Nerd facts for not nerd people

¿Que es un Virus? parte 1: Introducción.

2012-01-30T11:58:00.000-08:00

Silla?

Por lo general es muy difícil definir cualquier concepto. Y existen conceptos que son mas dificiles de definir que otros porque su definición esta ligada a un concepto que es aun más dificil de definir.

Por ejemplo, como definirían ustedes lo que es una "silla".

La primera reacción suele ser bien arrogante, algo así como "que fácil, yo se lo que es una silla", es facil imaginarse una. Pero según como se defina lo que es una "silla" dependerá si es o no es una silla lo que imaginaste.

Veamos. La RAE define como Silla : "Asiento con respaldo, por lo general con cuatro patas, y en que solo cabe una persona." Probablemente todos imaginamos algo como la figura.

Sin embargo, que pasa si DOS personas caben en la silla de la foto?
o, que pasa si la silla de la foto tiene 5 metros de altura?

Por definición entonces, deja de ser una silla.

Los grandes problemas en Biología, son problemas de definición de conceptos.

Uno de esos conceptos es el de un Virus.

A lo largo de la historia la definición de lo que es un Virus a cambiado varias veces. Por la misma razón, la definición actual no es ni será la definitiva.

Este post es el 1er de varios posts que tienen como intención describir el concepto de "Virus", para que, desde una jerga no técnica poder entender lo que son.

Progreso y Desarrollo.

2011-07-08T08:12:00.000-07:00

Tanto que se habla de progreso y desarrollo.

Las lucas, están todos preocupados porque creen que las lucas, el dinero es la solución.

Progreso y Desarrollo no es más que ideas y valores impregnadas en las mentes de su Pueblo.

Esfuerzo, disciplina, conocimiento, honestidad y justicia.

Cuando confiemos en nuestras autoridades, cuando confiemos en nuestro sistema de salud y de educación, cuando confiemos en los desconocidos en el metro.

Cuando seamos capaces de entregar un trabajo digno y bien remunerado a alguien y que este no se aproveche.

Cuando un poeta sea tan respetado como un ejecutivo, cuando un diputado deje de lado sus creencias por el bien común.

Cuando un científico sea el ejemplo a seguir de los niños.

Cuando estemos tranquilos viviendo en un Pais que nos respeta y que de vuelta nos esforcemos por el, y por nuestros nietos, y los nietos de otros que no conocemos.

Cuando el bien común se más importante que mi auto.

Seremos Desarrollados.

SON IDEAS! no lucas.

Tecnología más alla de los medios.

2011-02-18T21:33:00.000-08:00

Constantemente surgen nuevas noticias sobre "tecnología" en los medios de comunicación. Sin ninguna excepción el concepto de tecnología en que se basan para dar noticias es básico y acotado.

Por definición tecnología es la aplicación práctica de algún conocimiento. La definición de por sí habla por si misma, pero impacta el hecho que en medios se acoten a temas de Tecnología sólo a nuevos telefonos móviles, televisores, consolas de video juegos y computadores. Estos temas si son interesantes, sin embargo, el hecho de acotar la "tecnología" sólo a nuevos aparatos electrónicos acarrea un tremendo problema a mi parecer: este sesgo evita que se den a conocer la inmensa de la mayoría de los avances tecnológicos que están cambiando el rumbo y mentalidad de la humanidad.

En el mundo de hoy existe una serie de problemas prácticos en los que la ciencia básica esta aportando en conocimiento suficiente como para que estos problemas sean atacados de manera práctica, osea, se están generando tecnologías que están solucionando nuestros problemas globales y locales, y no necesariamente son aparatos electrónicos.

Años atrás, en la Revolución Verde el conocimiento generado en el ambito de la agricultura logró generar sistemas eficientes de cultivo, utilizando fertilizantes que lograron aumentar la producción por superficie de tal manera que logró sustentar el aumento poblacional que hubo en los 60, 70 y de ahi en adelante. En esa época áreas como la química y la biología se unieron para poder lograr este cometido. La Revolución Verde fue un avance tecnologico, sin embargo, basado en el concepto usado en los medios de hoy, no lo seria. Hoy el problema de la alimentación a nivel mundial es un problema, por la misma razón las ciencias biológicas han generado suficiente conocimiento para poder aplicarlo a la mayor producción por superficie, una de esta tecnología es la ingeniería genética de vegetales que sean capaces de sobrevivir y producir en suelos en donde simplemente no crecen especies de uso humano. Se esta intentando generar plantas que sean resistentes a altas concentraciones de sal, que sean más resistentes al frío, a la sequía, o en el caso del norte de chile el exceso de boro. E incluso el desarrolló de nuevas variedades de plantas en donde sólo ha habido selección genetica y no transgenía es otro tipo de tecnología. De la misma forma en que el maíz, tomate, frutillas y otros vegetales que nosotros conocemos se desarrollo por años por pueblos antiguos que mezclaban flores de las plantas con frutos más grandes con los otros más grandes, ahora se utiliza (con herramientas más sofisticada, como los SNPs ) para el desarrollo de variedades nuevas.

http://www.sciencemag.org

Otro tipo de tecnología que surgió industrialmente en los 40s fue el uso de antibióticos. A muchos se le olvida que antes la gente se moría por una infección bacteriana que para ahora es un simple y con suerte estarás en cama una semana. El desarrollo de nuevas aplicaciones en el área de salud también es tecnología, de hecho, cualquier tipo de terapia o droga es tecnología. Asi como en un tiempo se hacían sangrías para bajar la fiebre, ahora se desarrollan nuevas terapias basadas en el conocimiento generado por años por la ciencias básicas. Es cosa de ver todo lo nuevo que esta sucediendo con los RNAs de interferencia y microRNAs, es cosa de tiempo para que se aprueben las terapias basadas en estas moléculas. Estas terapias no tendrán ningún chip de por medio y siguen siendo TECNOLOGÍA. También nos encontramos con las células troncales inducidas (Induced pluripotencial Stem Cells). ¿Como no va a ser tecnología el hecho de desdiferenciar células de la piel para generar cualquier célula que queramos para curar enfermedades?

También existen nuevas tecnologías que se están generando para producir energía, en especial la fusión nuclear y el extraerla desde el agua. Tecnologías que estarán lejos de medios por su buen tiempo al parecer, por el solo hecho de que reuters no lo pone en su lista.

Hasta ahora he nombrado algunos ejemplos que son bastante extremos, ya que el conocimiento necesario para realizarlo es bastante. Pero si tomas un palo y lo usas para sacarte los mocos es tecnología. Los avances que hay son impresionantes y demuestran la belleza de la mente humana.

La mayoría de los avances tecnológicos ignorados impactarán de tal manera a la humanidad, que su mentalidad y comportamiento serán modificados, tal cual ya lo están haciendo unos.

The Opte Proyect (http://opte.org/)

Y los ejemplos de tremendos avances tecnológicos que aparecen constantemente en revistas científicas y son ignoradas por lo medios normales, sólo demuestran el pequeño conocimiento de los encargados de comunicarlas (ya sea periodista o quien sea) y además muestra el poco interes de los mismos por las ciencias, la tecnología y los avances de la humanidad.

Profes, educación y el ser autodidacta.

2010-05-28T10:30:00.000-07:00

Según mi opinión la gran falencia de la educación en nuestro país, más que técnica es conceptual. Seguimos con la creencia de que un profesor debe ser una persona que entrega hechos y datos como conocimiento. Este concepto es derivado de la educación de la era renacentista, época en donde había una escasez de acceso a la información existente. La cantidad de libros era tan escasa que la necesidad de un profesor era esencial para transmitir el conocimiento desde los libros a sus alumnos. En el presente el acceso a la información no es un problema gracias a la Internet y las fotocopias. Por lo tanto el rol de un profesor debe ser el de un guía y orientador con respecto a la manipulación y análisis de la información que existe. Los educadores de hoy deberían orientar sus enseñanzas a generar alumnos autodidactas y críticos. Para esto es necesario que el conocimiento que traspasen a sus alumnos sea orientado a ideas, conceptos, metodologías de trabajo y análisis de la información.

Así se pueden generar personas con herramientas intelectuales y espirituales para poder ser autodidactas y seguir su propio de conocimiento.

Actualización, 13 de Septiembre 2010.

Encontre este video en el tumblr de @valerialuna, Isaac Asimov, Bioquímico, y reconocido por su novelas de ficción, habla sobre su visión de la educación en un mundo conectado a travez de computadoras. No puede expresar mejor mi punto de vista antes expuesto. Gracias Don Isaac.

La importancia de las ciencias

2009-10-21T16:32:00.000-07:00

Es necesario entender el valor que poseen las ciencias en una sociedad. La investigaciones científicas han generado, generan y seguirán generando conocimiento que a largo plazo se concretan en una mejor calidad de vida para todas las personas. En general el trabajo de un científico es llegar a comprender un fenómeno que no se sabe como funciona, por lo tanto llegar a una compresión del fenómeno requiere de tiempos largos de análisis y discusiones con los pares de pequeños hallazgos obtenidos en base a pruebas y errores, los cuales tienen una continuidad lógica con respecto a conocimiento anterior del mismo u otros fenómenos. Sucede entonces que basados en evidencias científicas ciertos fenómenos son capaces de generar una aplicación: una invención. Este proceso es denominado innovación.

Todos los computadores, celulares, aparatos tecnológicos, vacunas, remedios, terapias médicas, energías renovables, satélites, televisión, software, plásticos, aleaciones, pesticidas, antivirales, antibióticos, Internet, biodiesel, aviones e infinitamente etc., que se utilizan hoy cotidianamente y que han aumentado no sólo nuestra calidad de vida, sino el tiempo de esta, existen y se comercializan gracias a que hubo una investigación científica previa. Investigación realizada por estudiantes de doctorado, post-doctorados y jefes de investigación. Los cuales nunca imaginaron que el fenómeno que ellos estudiaban y que no sabían como funcionaba, más la investigación de muchos otros grupos de investigación generaría en muchos años más, productos que cambian la forma de vida de las personas, y que además genera un alto valor económico a las naciones y sus ciudadanos que invirtieron en ciencias.

No es de extrañar entonces, que los países desarrollados inviertan una suma razonable de su producto interno bruto en investigaciones científicas, puesto que es gracias a estas que en un largo plazo retribuirá con creces las inversiones hechas previamente.

Las ciencias no son un capricho, son una necesidad de un país ambicioso como el nuestro. Si queremos erradicar la pobreza, mejorar la educación, aumentar el PIB y el ingreso per cápita, necesitamos pensar a largo plazo, invertir más del 2% del PIB en investigaciones científicas y esperar 30 años. Es difícil comprender el valor real de los científicos para la sociedad, pero si no fuera por ellos, sus pasiones por el conocer, su sacrificio por vidas más cómodas y sus “inútiles” investigaciones de largas horas de trabajo, nuestras vidas serían muy distintas, y claramente no mejores.

The Root of All Evil?

2008-09-30T01:16:00.000-07:00

Les muestro mi cerebro en 3D, porque no se que poner. los numero de al lado con colores son cuantas veces menos funciona o cuantas veces mas. aprendan neurologia para entenderlo, no les dire.

Mientras a que espero a que pase la noche para poder ir a clases y no quedarme dormido me encuentro que el final de un documental titulado "The Root of All Evil?"

Aunque es un documental que critica a la religion, no lo he visto entero para saber si es obetivo o no.

lo unico que vi fue el final, alcanze a ver esto y se me pararon los pelos de lo lindo. seas o no seas ateo.

"But atheism is not a recipe for despair. I think the opposite. By disclaiming the idea of a next life, we can take more excitement in this one. The here and now is not something to be endured before eternal bliss or damnation. The here and now is all we have; an inspiration to make the most of it. So atheism is life-affirming, in a way religion can never be. Look around you. Nature demands our attention; begs us to explore; to question. Religion can provide only facile, ultimately unsatisfying answers. Science, in constantly seeking real explanations, reveals the true majesty of our world in all its complexity.

We are going to die, and that makes us the lucky ones. Most people are never going to die, because they are never going to be born. The number of people who could be here in my place outnumbers the sand grains of Sahara. If you think about all the different ways our genes could be permuted, you and I are quite grotesquely lucky to be here: the number of events that had to happen in order for you to exist, in order for me to exist. We are privileged to be alive and we should make the most of our time on this world."

Heavy no?

http://video.google.com/videoplay?docid=9002284641446868316
link a google video parte dos

Calentamiento Global y Narcisimo.

2008-01-17T18:54:00.000-08:00

Debo reconocer que tengo una gran contradicción con respecto a la postura referente al calentamiento global. Los que estamos en el área de las ciencias hemos sabido hace mucho tiempo de esto, han salido reportajes en revistas importantes de ciencias con datos crudos y todo hace ene años atrás. Y el análisis del temita ha sido abundante.

"Man against nature in the climatic stakes"
Abstract: Latest indications suggest that all of man's polluting influences on climate may be acting to produce a global warming. Nature 258, 195 - 196 (20 Nov 1975)

Ojo con la fecha del paper. Nadie puede negar que no hay calentamiento. Nadie puede negar el hecho de que muchas especies desaparecerán y que los climas cambiarán.

La pregunta que me tiene en un limbo es: ¿Es malo?. (Igual decir en un carrete que te da lo mismo el calentamiento global no es muy bien visto)

Me cuesta darle valor moral a cualquier cosa. Si, no sería bueno que el dragón de Australia se extinga, ni que el coral desaparezca. Pero sólo desde nuestro punto de vista y con una visión muy acotada del tiempo.

Los humanos somos una especie demasiado narcicista, y estamos ultra preocupados de que se vuelta inhabitable la tierra y que la raza humana se extinga, y junto a nosotros miles de otras especies. Y saben creo que en realidad la preocupación no va por las otras especies, vemos como hacen pedazos a muchas especies y hábitat sin el mayor remordimiento. Por ende seria solo un preocupación fundamentada en un ego injustificable.

Pero hay que pensar que hace 2.5 billones de años no existía oxigeno en la tierra, y estaba repleto de ciano bacterias (que no necesitan oxigeno para vivir) que lograron con el apoyo de muchos años crear mucho oxigeno para que otro tipo de seres pueden existir. Eso debió haber sido una especie de "Global Warning" para las ciano bacterias. CianoAlGore hace 2.5 billones de años atrás hubiera dicho "hey ojo, se está extinguiendo el metano de la atmósfera, todos moriremos". Y claro ya no son la única especie en la tierra pero gracias a esos cambios "caóticos" las flores lograron alzarse, y los árboles y los humanos y con ellos la música, el arte y las ciencias.

Y creo que escribiendo en este blog, me tiró al agua y salgo de limbo y acuestas de los prejuicios que tengan de mi declaro:

"NO ME IMPORTA EL CALENTAMIENTO GLOBAL!!!"

"ME DA LO MISMO QUE LA HUMANIDAD SE ACABE"

La extinción de especies es natural, si el humano no es capaz de sobrevivir en un paraíso lleno de abundantes atribuciones, y bellísimos rincones, no merece vivir ahí.

A la naturaleza le importa un bledo que nos extingamos, creará otras especies, con otras capacidades, que obtengan energía de otro gas de otra atmósfera.

Quizás hasta se cree una especie más inteligente que nosotros, menos violenta, mas compasiva, ,que sea capaz de comprender la belleza más profundamente que nosotros y que proteja el conocimiento que logró revelar y guardar.

Y por lo demás algún día se acabará el sol, y la vida en la tierra como fenómeno habrá sido una anécdota en la infinidad de tiempo que tiene este universo. Sería así como una milésima de segundo de nuestras vidas. (así como cuando ves a tu enamorada por primera vez, el milésimo de vida mas relevante que hay, y mas impactante e importante que toda una vida (humana)).

De todas maneras no está demás preocuparse, e intentar mantener limpio el planetita es como vivir en una casa sucia y hedionda. Pero a la larga, es irrelevante. Porque en el fondo somos irrelevantes.

....

http://www.naturenotes.org/notes/dpaleo/paleo_niveloxigeno.htm
Nature 451, 277-278 (17 January 2008)

.................................................

XCVI

Pienso, esta época en que tú me amaste
se irá por otra azul sustituida,
será otra piel sobre los mismos huesos,
otros ojos verán la primavera.

Nadie de los que ataron esta hora,
de los que conversaron con el humo,
gobiernos, traficantes, transeúntes,
continuarán moviéndose en sus hilos.

Se irán los crueles dioses con anteojos,
los peludos carnívoros con libro,
los pulgones y los pipipasseyros.

Y cuando esté recién lavado el mundo
nacerán otros ojos en el agua
y crecerá sin lágrimas el trigo.

Pablo Neruda (Cien Sonetos de Amor)

NADA

2007-12-02T13:41:00.000-08:00

Tiendo a perder el tiempo pensando en nada.

Y... después de mucho tiempo de contemplar todo lo que puedo.

Siempre, quedaba con la sensación de comprender.
De saber que la verdad, estaba en el silencio.

Que todas las respuestas y preguntas eran los mismo, y radicaban en el cero, la nada, el vacío.

En contradicción a esa sensación, la percepción me mostraba todo un movimiento,
como cuando vemos el viento jugar con los árboles, o las estrellas moverse.

Ahí entonces sentía el Logos de Heráclito, y la sensación de infinito cobraba vida, y la frontera entre yo y el universo dejaba de existir, y notaba que TODO era UNO.

Las ondas son fenómenos de transferencia de energía, o energía misma ( no se bien en realidad, que me corrija un físico). Pero si hay una onda hay energía. (lean los post con título Vida parte algo, para que entiendan a que me refiero con energía). Las ondas tienen propiedades y características.

Pero sin darme tantas vueltas. Las ondas cuando se encuentran producen un fenómeno que se llama interferencia, que sería el fenómeno en el cuál las ondas "interaccionan" entre ellas.

Si juntamos dos ondas, una en un desfase de 180 grados (ver figura). Se produce una interferencia destructiva. Esto implica que la sumatoria de ambas ondas es cero. No hay nada.

Si fuesen dos ondas de sonido, de dos ondas sonoras, obtenemos cero sonido.

Podríamos entonces, obtener algo a partir de la nada. Por ende la nada en el fondo no existe. O nada existe y todo es nada.

De todas maneras me tiene un poco desquiciado, pensar que de la nada se puede crear lo que sea.

Llegué al punto de considerar que nada es tan irrelevante como todo. Todo es tan innecesario como necesario. Y termino admirando. Contemplando. Y viendo que la verdadera certeza esta en el vacío. Y que a partir de eso todo se crea, pero sigue siendo vacío. Es como si toda la naturaleza, vida, emociones, sentimientos, carne, piedra, viento, fuego, mar y cielo se sustenten en la nada. Es como si todo fuese una fórmula gigante e inexplicable cuyo resultado es igual a cero.

Sabiduria Molecular y las plantas.

2007-10-11T21:19:00.000-07:00

De las noticias de la semana de la revista Science, salió esto.

"Many plants coordinate their annual time of flowering with particular seasons of the year, and one indicator that they use to determine the change of seasons is day length. Sawa et al. (p. 261, published online 13 September; see the Perspective by Rubio and Deng) provide some insights into the molecular interactions that translate day length into flowering initiation. The day needs to be long enough for the blue-light-stimulated expression of proteins FKF1 (FLAVIN-BINDING, KELCH REPEAT, F-BOX1) and GIGANTEA (GI), to coordinate. The daily rise in expression of GI lags far enough behind the daily rise in expression of FKF1 that, in the shorter days of the year, daylight has waned by the time there is enough GI to form complexes with FKF1. With the longer days of spring and summer, there is enough time to form complexes and signal to the CONSTANS gene to trigger the flowering pathway."

Me encanta encontrar explicaciones a escalas nanométricas de fenómenos tan bellos y místicos.

Me maravilla pensar como se crearon estos sistemas tan complejos y bellos. Y encontrarles explicaciones moleculares me provoca admirar aun más la naturaleza.

Y es sorprendente que, las plantas utilizen flores para que un insecto se sienta atraído por sus colores para así encontrar el alimento necesario para su subsistir, y además sin saberlo poliniza las flores de las plantas que después crecerán y se multiplicarán y así entonces, los insectos de la misma especie tengan más flores donde encontraran el alimento, (mmm... al parecer los insectos son más sabios que los humanos) . Para eso es necesario saber cúal es la fecha en la cúal las semillas de las plantas tengan máyor probabilidad de sobrevivir y crecer. Comó tambien es necesario saber cuando existirán más insectos que polinizarán las flores. Además los insectos deben saber cuál es la fecha con mayor probabilidad de sobrevivencia y esa fecha curiosamente debe coincidir con la época de mayor flores. Por eso hay más bichos voladores en verano y primavera.

Esta sabiduria está codificada por interacciones fisicoquímicas y termodinámicas de moléculas sintetizadas especialmente para este propósito.

Más impresionante aun, es que un animal sea capaz de crear un lenguaje que ayuda a definir conceptos abstractos como la palabra belleza. Si, la belleza es creada por el hombre, no existe. Es el humano que se maravilla, el humano que necesita que exista "lo bello". Necesita admirar, contemplar y preguntar. La belleza nació sólo cuando nació nuestro sistema nervioso central. Y esa capacidad tambíen está codificada por interacciones fisicoquímicas y termodinámicas de moléculas sintetizadas con un próposito. ¿Cuál es este propósito?. No tengo idea.

I celebrate myself, and sing myself,
And what I assume you shall assume,
For every atom belonging to me as good belongs to you.

I loafe and invite my soul,
I lean and loafe at my ease observing a spear of summer grass.

My tongue, every atom of my blood, form'd from this soil, this air,
Born here of parents born here from parents the same, and their parents the same,
I, now thirty-seven years old in perfect health begin,
Hoping to cease not till death.

Creeds and schools in abeyance,
Retiring back a while sufficed at what they are, but never forgotten,
I harbor for good or bad, I permit to speak at every hazard,
Nature without check with original energy.

Walt Whitman: From Song of Myself (1855)

Amor parte III. Allostasis y placer.

2007-09-30T20:05:00.001-07:00

¿Se han fijado que cuando tienen sed, quieren tomar agua? Suena super normal, pero para que suceda este fenómeno es requiere de un mecanismo ultra complejo y muy bien calibrado. Como cuerpo tenemos que mantener un equilibrio interno en respuesta a los cambios externos e internos. Cuando el cuerpo no es capaz por si solo de mantener el equilibrio, recurre a un mecanismo muy especial, la MOTIVACIÓN.

Osea si nos falta agua, tomaremos agua. Si sentimos calor nos pondremos en la sombra. Pero tiene que existir una motivación, nada es gratis. Entonces en el cerebro se han creado circuitos que están dedicados a la motivación. La máxima motivación que existe es el placer. Uno establece relaciones entre ciertas situaciones y placer, un imagina que come algo que le gusta y evoca placer al hacerlo. El placer pareciese ser el switch entre lo que hay que hacer y lo que no. Y existe un núcleo en el cerebro encargado de eso.

Los animales (como los seres humanoas) tambíen sienten placer, comer produce placer, porque las cosas que producen placer hacen bien, ayudan a sobrevivir.

Nuestra memoria es capaz de evocar sensaciones, y esas sensaciones se relacionan con alguna situación. Cuando alguna situación nos produce placer, lo recordaremos e intentaremos buscarla nuevamente.

La angustia sería entonces la sensación contraria al placer. La angustia generalmente aparece cuando se nesecita una situación con la cuál se siente placer pero no es posible obtenerla.

Pienselo de esta forma. Un humano primitivo se encuentra con una depredador. Eso produce angustía porque evocara sensaciones de no-placer. Al contrario, buscará comida si no tienen porque sentirá angustia ya que necesita sentir placer al comerla, porque el cuerpo creo atravez de los años, evolucionando un mecanismo que motiva a buscar comida porque comer es necesario (Dah!?).

Ahora, los mecanismos que ayudan a la sobrevivencia de la especie tienden a producir placer y en mamíferos el sexo es importante para mantener la especie.

Entonces resumiendo, cualquier cosa que nos evoque la sensación de placer, la buscaremos, como buscamos agua cuando tenemos sed. Ya que el cerebro ocupa las mismas vias neuronales.

¿Que sucede cuando el buscar placer, o las situaciones que producen placer, son contradictorias con la sobrevivencia?

SCHISM Tool

I know the pieces fit cuz I watched them fall away
mildewed and smoldering, fundamental differing,
pure intention juxtaposed will set two lovers souls in motion
disintegrating as it goes testing our communication
the light that fueled our fire then has burned a hole between us so
we cannot see to reach an end crippling our communication.

I know the pieces fit cuz I watched them tumble down
no fault, none to blame it doesn't mean I don't desire to
point the finger, blame the other, watch the temple topple over.
To bring the pieces back together, rediscover communication.

The poetry that comes from the squaring off between,
And the circling is worth it.
Finding beauty in the dissonance.

There was a time that the pieces fit, but I watched them fall away.
Mildewed and smoldering, strangled by our coveting
I've done the the math enough to know the dangers of a second guessing
Doomed to crumble unless we grow, and strengthen our communication cold silence
has a tendency to atrophy any sense of compassion
between supposed lovers
between supposed brothers.

And I know the pieces fit.

Una de las más razonables razones para no ser un Philosophical Doctor.

2007-09-11T23:59:00.000-07:00

La triste verdad.

He estado desaparecido, he descubierto cosas muy interesantes....

No les puedo contar... pero me gustaría.

Una de las mejores razones para ser un Philosophical Doctor.

2007-09-11T19:14:00.000-07:00

"Cuál es mi nombre!!!"

Amor parte II. Homeostasis

2007-08-22T14:08:00.000-07:00

Como cuerpo tenemos que mantener un equilibrio interno en respuesta a los cambios externos e internos. Es crítico tener un buen control por ejemplo, de la temperatura corporal, o del volúmen de agua, o la presión sanguínea etc etc. Existen sensores en todo el cuerpo que estan constantemente viendo si alguno de estas exigencias se mantiene dentro de un rango normal. Cuando se aleja de este rango normal el cuerpo intentará reponerlo, primero internamente y luego en base a soluciones exógenas.

El proceso de mantener una estabilidad interna se le llama homeostasis.

Les pongo un texto que encontré por ahí que hablaba sobre el mítico Dr. Luco el cuál fue a trabajar con Cannon en 1936. (ojo con la fecha) aquí relata como les enseñaba el concepto de homeostasis a sus alumnos.

"Cannon era el autor del concepto de homeostasis, una característica distintiva que separa a los organismos vivientes de los sistemas complejos inventados por el hombre, como es su capacidad de mantener la estabilidad interna normal frente a cambios externos. Los mecanismos que regulan y mantienen las constantes fisiológicas (presión arterial, temperatura, equilibrio, etc.) son independientes de nuestra voluntad. El doctor Luco sostenía que, gracias al automatismo de esos procesos reguladores, la voluntad humana es, en condiciones normales, independiente del organismo vegetativo: ‘Esta independencia es un don inapreciable que hemos recibido de la naturaleza. Si tuviéramos que preocupamos de mantener las estructuras y las funciones no tendríamos tiempo para ningún otro quehacer’. Durante una clase a los estudiantes de medicina quiso ilustrar este concepto y proyectó un grabado que representaba a Don Quijote, esperando angustiado la respuesta de Dulcinea a su mensaje de amor. ‘Les dije a mis alumnos: Si en esa noche fría Don Quijote de la Mancha hubiese tenido que preocuparse de mantener la constancia de sus medios y sistemas, no habría podido dedicar su imaginación contemplativa a la dueña de su corazón. Don Quijote tuvo libertad suficiente para amar a Dulcinea, y Cervantes para crear a Don Quijote’. "

CARTA DE DON QUIJOTE A DULCINEA DEL TOBOSO

“Soberana y alta señora.

El ferido de punta de ausencia, y el llagado de las telas del corazón, dulcísima Dulcinea del Toboso, te envía la salud que él no tiene. Si tu fermosura me desprecia, si tu valor no es en mi pro, si tus desdenes son en mi afincamiento, maguer que yo sea asaz de sufrido, mal podré sostenerme en esta cuita, que además de ser fuerte es muy duradera. Mi buen escudero Sancho te dará entera relación, oh bella ingrata, amada enemiga mía, del modo que por tu causa quedo: si gustares de acorrerme, tuyo soy; y si no, haz lo que te viniere en gusto, que con acabar mi vida habré satisfecho a tu crueldad y a mi deseo."

... miren ahora el grabado de arriba.

Fear Through the Eyes of Madness

2007-08-21T20:22:00.000-07:00

The advantages of Learning - K.Rexroth

I am a man with no ambitions
And few friends, wholly incapable
Of making a living, growing no
Younger, fugitive from some just doom.
Lonely, ill-clothed, what does it matter?
At midnight I make myself a jug
Of hot white wine and cardamon seeds.
I a torn grey robe and old beret,
I sit in the cold writing poems,
Drawing nudes on the crooked margins,
Copulating with sixteen year old
Nymphomaniacs of my imagination.

Humor y un post latero.

2007-07-31T13:13:00.001-07:00

Dentro de mis busquedas ociosas en internet encontré que muchos, y de los más importantes guionistas de los simpsons tienen un background científico, lo cuál me sorprendió. Acá ser científico no es muy valorado, socialmente en chile es super bueno ser ingeniero comercial o abogado. Es un país bien fome en ese aspecto, mucho estandar.

Nunca se sabe donde terminaremos o que estaremos haciendo, y viendo mi carácter y personalidad mi intento es poder dedicarme a todas las áreas que quiero y adoro, y empezar por las ciencias es un buen paso, nosé si seré cientifico en el futuro, pero se que da lo mismo lo que termine haciendo si es que termino contento y tranquilo.

Estube leyendo un artículo del New Yorker sobre George Meyer catalogado como el hombre más chistoso detrás de la serie más chistosa. Este tipo está desde la primera temporada de los Simpsons escribiendo guiones, y adivinen, es BIOQUÍMICO!!!. Coolísimo. Además está lleno de PHDs como de Física, computer sciences, y cosas así. Hay otro que es un Inglés que estudió biología y filosofía (como seguro terminarán alguno de mis compañeros).

Intenté buscar una relación entre la ciencia y el humor. y clack!!! me dio lata pensarla, entonces buscaré algún argumento de parte de los ñoños sobre el humor.

¿Porqué tenemos humor? Perfectamente podríamos ser todos como abogados.

Un comportamiento ligado al humor es la risa, en primates superiores (no señor, se equivoca, son chimpanzees o gorillas, no políticos) existe un comportamiento parecido a la risa, en especial cuando se hacen cosquillas entre si, además, en los jóvenes existen comportamientos provocadores que producen entretención, como por ejemplo tirarse caca, en especial a los más mas viejos, estos reaccionan haciendoles cosquillas o mandarlos a la chucha. Entonces se podría decir que sirve para tantear los limites sociales y jerargicos de su sociedad.Ojo! es la versión jackass del national geographic!. Entonces con esto podemos sacar dos conclusiones, una que la risa es un comportamiento que tiene al menos 14 millones de años (la edad de los chimpanzees) y dos que los políticos se comportan como chimpances jóvenes.

La risa se puede ligar al humor, pero no es suficiente, el humor tiene un complejidad relacionada más al lenguaje, generlamente el humor en humanos relaciona dos conceptos contradictorios en su significado.

Una técnica para ver la evolución de ciertos comportamientos derivó en la ontogenia, se supone que la ontogenia se basa en el hecho de que el proceso de desarollo a la madurez es comparable al progreso evolutivo de un organismo. Entonces si vemos como cambia el humor en niños podríamos adivinar como evolucionó el humor en humanos. (se supone). El punto es que las guaguas desde que nacen tienen un sentido del humor que esta caracterizado por ser disparado al solucionarse una situación incierta e incongruente, después de los 6 meses y hasta un poco despues del años encuentran super chistoso que alguien se esconda y luego aparezca. Ya despues de los 8 años son capaces de encontrar un historia con un incongruencia chistosa. Osea, si lo extrapolamos a nuestra historia primitiva, Jerry seinfield hubiera sido el mono que se esconde y luego aparece.

Hay enfermedades relacionadas al humor tb, por ejemplo los que sufren epilepsias en el lóbulos frontal tienden a no tener un humor muy desarollado, por otra parte en 1962 hubo un ataque de risa de 200 niños en Tanzania, que duró un par de meses, la wea freak.

Tanto bla bla y no llego a nada!!! que lata.

La wea es que el humor es util a nivel social, nos ayuda juntar personas con definiciones morales parecidas sin tener que estar en pastoral o algo como eso. A Nivel evolutivo es util porque nos produce placer, estar con gente y sentir placer a la vez crea comunidad y es super util cuando te quieren comer algunos felinos, por lo demas, no hay nada como el humor para sobrellevar los pequeños dramas de la vida, como por ejemplo quedar homeless (denuevo) o cuando llevas tres meses haciendo funcionar una puta traducción in vitro.

Este post es una lata!!!! no lo lean

Bioquímica y Roberto Matta

2007-07-18T13:22:00.000-07:00

Quizás con el Matta pudiese haber pelado el cable sin ser disciminado por cuadrado por ser científico y Bioquímico. (Ya me ha pasado con "artistas")

Una de las grandes preguntas que un Bioquímico debiese hacerse es: ¿Que es la vida?, ¿Que es el ser humano?. Matta en este video explica muy bien lo maravilloso del fenómeno que es la vida, los seres humanos y porque un cientifico como yo, esta Obsecionado con responder a estas preguntas fundamentales.

Las Artes son más parecidas a las ciencias de los que podemos imaginar, ambos estamos en el extremo del conocimiento, creamos conocimiento nuevo, y nos hacemos e intentamos responder las mismas preguntas, las de veritas, las de fondo.

Este video me incentivo hace un par de años a tomar ramos de arte cuando tuve mi crisis vocacional de 4to año. Casi saco un minor en escultura (me faltó un ramo) Igual era bien malo.

Pero tenía una gracia muy cool, eso de estar manipulando materia durante horas tenía un toque de meditación. El encuentro con el "ahora". Si pueden léanse "El Cuerpo Presente" de Varela. Pintar tiene el mismo cuento. Por eso hago puras weas cuando experimento con las Artes, porque en el fondo me da lo mismo el resultado, disfruto el hacerlo. La sensación es parecida a cuando me iba sólo a Cole-Cole (al norte de Cucao-Chiloé) llega un punto en donde desaparece la conciencia del futuro y del pasado y solo eres parte de Todo, o Logos como le decía el amigo Heráclito.

El realizar un experimento científico es muy parecido, se debe vivir el ahora.

Existe una forma de epilepsia en la cúal antes de una ataque convulsivo, las personas tenían una sensación extrema de placer. Todos aquellos la describían como un placer mejor que comer, mejor que el sexo, mejor que cualquier otro placer, y todos decían la misma frase "Me sentía parte del todo". Que quiere decir?

El todo es demasiado parecido a la nada (vacio), son como los extremos entrópicos, desorden o orden total.

El punto es que quizás la felicidad no es una euforia, sino la calma más pura. Y cuando están en esa calma, dejas el pasado y el futuro y eres TU ahora, ni un segundo más ni uno menos.

Debemos estar concientes de nuestra existencia, debemos recordar que poseemos un cuerpo, el recordarlo nos asienta en lo mas profundo de nuestra existencia.

Amor parte I. Prólogo.

2007-07-15T10:52:00.000-07:00

Mega salto. Dejaré por un rato de escribir sobre células y complejidades termodinámicas, para pasar al tema más complejo, relevante y abstracto de todos.

El amor.

Es una buena época para hablar sobre estas cosas porque llevo meses analizando muchas cosas con respecto al temita. Porque como sabrán ustedes soy un gran mamón y mega sensible ultra ñoñazo. Entonces para poder comprender mis comportamientos, emociones y mi historia le he dedicado un tiempo enorme de análisis al tema. Lo interesante es que como soy un ñoñazo no sólo serán las volás que todos tienen, sino que además le meteremos un poco de neurociencia, porque claro no podemos desligarnos de nuestro cerebro, lamentablemente como en todos los temas no soy un experto y por ende es probable que me falten algunas cosillas y quizás tenga algunos errores, pero como sé que tengo amigos expertos ellos contribuirán y al pasar los posts tendremós un análisis profundo y multifacético, que por lo de más será complementado con noches de cerveza alcohol y música con mis amigos.

Todos nos hemos hecho diez mil preguntas sobre el tema. Llevo años tratando de comprender el comportamiento humano desde mi humilde perspectiva, pero como tengo la suerte de tener amigos que saben mucho más que yo sobre estas cosas he logrado tener una recopilación mental de ciertos patrones y he logrado encontrar algunas explicaciones (no muy satisfactorias) pero explicaciones en sí.

En los últimos meses han pasado mil cosas y por suerte tengo un tremendo sicólogo con el cúal he aprendido más que la chucha y me ha ayudado mucho en poder vivir más tranquilo, y también a comprender mi ser y caracter.

A lo largo de mi historia, nunca he logrado ser amado, nunca he tenido un pololeo (de verdad) el único duro 2 semanas y fue más bien una anécdota bizarra. Y como todos tenemos una necesidad afectiva bien grande, la falta de eso me ha hecho tener muchas preguntas y por ende muchas respuestas. Y ya con mis casi 27 años estoy logrando tener una noción del porqué soy como soy. Y creo que en el fondo en estos temas funcionamos re parecidos, y de ahí les explicaré porque creo que somos todos re parecidos en estos temas a pesar de que reaccionamos, queremos y nos comportamos distintos ante ciertas circunstancias.

Emocionados? yo lo estoy, y ahora que estoy ultra feliz, mega tranquilo podré dejar de lado las subjetividades (en cuanto se pueda) e intentar regalarles mis conclusiones y preguntas y temas.

Jajajajaa que heavy esto, porque son dudas y preguntas que he tenido hace mil años y ahora las tiraré al viento. Espero que sean bien recibidas.

Traten de no poner comentarios pesados y sin sentido alguno, puesto que en realidad son inesesarios, y gracias a todos por sus comentarios tan bonitos y con altura de mira.

Ahhh lo olvidé, muchos podrán decir "y vo que sabí del tema" y la respuesta es super simple. "Nada". Y en realidad eso es lo interesante, puesto que de ahí parto. Intentar comprender desde mi punta de vista algo de lo cúal no tengo la puta idea. Mi interés no es contar certezas ni fundamentos, sino que son sólo ideas. Y considero que las ideas por muy equivocadas que puedan ser, por el hecho de ser ideas son válidas. Su fundamento son su existencia. Como todas las ideas.

Vida parte V: Célula "de novo"

2007-07-05T17:19:00.000-07:00

Lo bueno del lab es que tienes muchos momentos de espera. Por ejemplo, ahora estoy haciendo una transcripción in vitro de una rna de luciferasa. Es como la segunda vez que intento hacer esta cuestión. Mezclo y espero dos horas. Es interesante porque tendrá relación con el post de ahora. De hecho, le sacaré un foto ahora a la transcripción. (es como cocinar, le pones los ingredientes, sus enzimas en condiciones adecuadas y listoco (bueno no es tan fácil, me cuesta caleta que salgan las weas, soy bien torpe y hay que ser muy fino y meticuloso sino todo se degrada). En el tubo están los reactivos, lo naranjo es una esponja que está en un baño térmico que le puse azul de metileno para evitar que crezcan hongos.

El tema será el flujo de información genética dentro de un ser vivo. Será sólo un preludio. Primero hay que entender conceptualmente que es una célula.

Vamos a imaginar que la célula es una fábrica de un libro, ese libro tiene la información para hacer la misma fábrica de ese libro. En ese libro tendremos la información necesaria para: crear los componentes necesarios para hacer la fábrica, mantener la fábrica funcionado y crear componentes que elaboren el libro.

Entiendan bien el párrafo anterior. Imaginense todas las situaciones en las cúales podría existir la fábrica, en los distintas divisiones que debe tener para optimizar funciones. Cómo se debe adaptar a los cambios del clima, de la economía y sociales. A la demanda de los compuestos para mantenerla activa. Es la manera más simple que se me ocurrió de explicar que es una célula.

Ahora el libro que denominaremos maestro, será el que tiene toda la información, osea el DNA por lo mismo es muy importante mantenerlo intacto. Lo que hace es transcribir las páginas necesarias para hacer algún proceso o objeto. Por ejemplo, si se necesita construir un water de la fábrica, irá el un agente especializado en transcribir en borradores las páginas del libro maestro que contienen la información para construir un water. Estos borradores se utilizarán mientras se construyen en el water y luego se botan. Porque si se mantiene un borrador mucho tiempo es probable que la información sea cambiada (se puede borrar o modificar), entonces la fidelidad con respecto a la información del libro maestro será siempre igual. Si necesitamos muchos waters tenemos dos formas de regulación, cuantos borradores tenemos o cuanto se ocupan. Para construir el water se necesita de los constructores y de los materiales. Estos serán también construidos previamente por la célula.

Luego se construye el water, que en fondo por el hecho de existir tiene la información tácita en sí como objeto, de la información contenida en el libro maestro.

El libro maestro vendría a ser el DNA, el DNA contiene la información necesaria para mantener a una célula viva, funcionando, y además contiene la información nesesaria para responder a los cambios de ambiente.

El water puede ser una proteína.

Recuerden que la célula tiene que ser un ente autónomo, por lo mismo no puede pedirle a nadie un water, tiene que construirlo solito. A pesar de eso a lo largo de la evolución las células han logrado crear comunidades en las cuales cada una tiene funciones específicas, lo que vendría a ser una organismo multicelular (como nosotros los humanos, o los calamares, o los abogados). Lo curioso es que cada célula contiene en su DNA la información para construir cualquier componente de cualquier tipo de célula o ser cualquier tipo de célula. Y es obvio porque todos los seres son creados a partir de una o dos células, luego se van multiplicando y luego especializándose.

Por eso en teoría podríamos tomar cualquier célula de cualquier tipo y crear un ser a partir de eso. Es como si tomaran una célula de piel y de eso crearan un humano. Aun hay misterios con respecto esto pero este año se ha avanzado harto en eso. En un futuro próximo seremos capaces de hacer un organismo a partir de una célula x, que vendría a ser lo que se llama clonación, pero ojo la clonación que se ha hecho se denomina clonación por transferencia nuclear que no es lo mismo que tomar una célula y hacer un organismo.

A pesar de que una célula contenga toda la información no la utilizan toda, ocupa sólo que necesita. Por ejemplo las células de hígado sólo producirán proteínas diferentes a las del corazón, pero el DNA de las células es el mismo. También hay que pensar que las condiciones externas e internas van cambiando entonces el DNA también contiene la información para producir proteínas que se utilizarán sólo en ocasiones especiales.

Por eso la célula es "autónoma" entre comillas puesto que su origen es dependiente de una célula anterior, y de los componentes que la constituyen que está codificada en el DNA. Es un círculo vicioso.

Osea, si tenemos sólo DNA con toda la información necesaria para construir una célula no es capaz de construir una ya que necesita de proteínas y compuestos que su propia información contiene pero sin ellos no es capaz de construirlas.

http://www.studiodaily.com/main/technique/tprojects/6850.html
Ahí hay una animación que intenta mostrar lo que dentro de una célula sucede. Está bonita!!!

AHHHH!!!! me demoré una semana en escribir esta cuestión no apagué mi compu pa tenerlo abierto para poder cambiarlo arreglarlo (cachen la fecha lo subí el 11), y nose si quedó bien. Creo que esta enredado. Ando un poco perdido por la vida y medio distraído. Será, sino lo subo ahora no se sube nunca.

Disculpen y un abrazo.

Vida parte IV: Arte y energía.

2007-06-30T13:18:00.000-07:00

Hace poco di una clase en un colegio sobre las cosas que escribo acá. Y a las cabras les costó cachar bien los conceptos, puede ser que haya sido por el poco tiempo que tuve para dar mi clase, y al parecer también es re jodido el tema. De todas maneras seguiré escribiendo sobre estas cosas para pasar a otros temas ñoños. Creo que este post será el último con respecto a energía, pero será el más interesante. El tema no lo manejo bien (los anteriores tampoco) pero si creo tener nociones sobre el tema, esto lo aprendí con mi gran amigo Evandro, que ahora esta en Suiza, mientras nos tomábamos el casi sagrado café del día pelando el cable sobre ciencias y sobre la vida (que ha estado ultra movida estas últimas 4 semanas)

Espero que hayan quedado claros ciertos conceptos de los otros posts.

Este post relacionará el concepto de energía con la información. La definición que sale en google es:"Information is the result of processing, manipulating and organizing data in a way that adds to the knowledge of the person receiving it". Esto incluye todo tipo de lenguaje, todo lo referente a las percepciones (visual, sonidos, tacto, etc). Se entiende, cierto?

Imaginen que tienen una bolsa llena de las letras para las sopas. Toman todas las letras y las tiran. Cuál es la probabilidad de que cada vez que tiramos las letras al suelo se formen palabras con sentido y que éstas formen frases coherentes?.

Ninguna!!!!!! Sería súper difícil. La probabilidad es muy pequeña.

Como sabemos de los post anteriores, cualquier fenómeno que tenga una probabilidad muy pequeña de que suceda, y sucede, requirió mucha energía para poder existir. Por consecuencia si existe, contiene en sí mucha energía.

Eso ocurre con la información.

Podemos darles un valor energético a la información, y por lo mismo podemos darle un valor de probabilidad a la información contenida en cualquier cosa.

Bueno, para que algo contenga información necesariamente tiene que ser comprendido, y también podemos darle un valor de probabilidad a que la información sea comprendida.

Por ejemplo, cuál es la probabilidad de que ustedes entiendan lo mismo que yo cuando les pongo la palabra "instrumento". No es muy alta, puesto que unos se imaginarán instrumentos musicales, otros herramientas. Ahora, si lo pongo en una frase "toqué música con mi instrumento", el hecho de ponerle un contexto aumenta la probabilidad de que lo entiendan, y cada palabra tiene una probabilidad, y juntas en un orden aumentan la probabilidad de que entiendan exactamente lo que les quiero decir.

El arte contiene energía porque es información, la música también, los poemas.

Y cada uno tiene niveles de energía distintos, por ejemplo es mucho mas fácil explicar algo con un libro, pero con un poema es más complejo, y por eso la densidad de energía es mayor en un poema, puesto que la misma información que está contenida en el libro que tiene por ejemplo 300000 palabras, está contenida en un poema que tiene 100.

Toda obra de arte contiene energía. Y la música!!!! jajajaja es muy entretenido este tema. Y cada obra para ser creada requiere de mucha energía. Recuerdan el ejemplo de la bomba atómica en un post "lo superfluo de la energía"?. cito: "Porque hacer que algo que sea poco frecuente ocurra implica mucho esfuerzo. Y cuando los fenómenos poco frecuentes ocurren tienden a provocar que ocurran otros fenómenos poco frecuentes". Les suena eso como a arte?. Los artistas crean el mundo que viene.

Por eso admiro a los artistas, ya sean músicos, pintores, poetas, etc, etc.

Y aunque todos mis amigos crean que soy más artista que científico, y de que siempre debí haber estudiado eso, lamentablemente no lo soy. Aunque haya vivido como un poeta beatnick buena onda y loco (como me dijeron ayer que era).

Espero ser artista después de terminar bioquímica mientras haga mi doctorado en alguna parte lejana de este mundo.

Y quiero porque no sólo es una frustración, sino porque son los artistas los que más saben sobre lo único importante, lo que rige al mundo y sus personas.

La esencia de la vida.

Tributo

2007-06-27T11:49:00.001-07:00

Este post, será un tributo a esos amigos científicos.

Lo más importante de mi paso por la universidad fue conocerlos.

Aquellos que me conocen sabrán que vivo en un mundo muy abstracto. Vagando romántico medio loco por la vida. Todas mis locuras y extraña forma de ser fueron apreciadas. Con estas personas logré encontrar un nicho en el cúal todas mis preguntas, frustraciones, dudas, y alegrías fueron comprendidas y acogidas.

Ellos siempre tuvieron más confianza en mi de lo que yo la tenía. Y sus consejos y apoyo fueron importantísimos.

He comprendido mis debilidades y fortalezas, Y creo que estoy comenzando a amarlas. Como consecuencia, recien ahora siento que soy capaz de lograr amar lo que hago, y amarme haciendolo.

Y estos compadres, fueron escenciales en este proceso. En este minuto están todos fuera de Chile, viviendo duramente, como hijos del rigor por una pasión más grande que por lo inmediato.

He aprendido más de ellos que de cualquier libro o paper.

Y con este humilde post, les declaro mi admiración y cariño.

Gracias!.

Vida parte III: La entropía del pucho.

2007-06-21T09:58:00.000-07:00

Entropía es una palabra que suena cool. Pero no es fácil de entender, (yo no la entiendo bien) pero humildemente intentaré explicarla.

Imaginemos el sistema más estable que puede existir. Este sería un sistema en el cuál todas las partículas están lo más alejadas una de la otra. Tendrá que ser un sistema completamente desordenado. Este sistema se definirá como el estado con máxima entropía.
Ahora, cualquier proceso que ayude a que el estado universal se acerque a ese sistema ficticio producirá entropía. Entonces si todos los fenómenos pasaran de un estado de menor entropía a uno de máxima entropía llegaríamos al estado ficticio de máxima entropía donde nada se diferenciaría de nada y todo estaría alejado de todo. Como todos sabemos nosotros no vivimos en un universo así, ni en un planeta así. La entropía entonces define el desorden de un sistema. A mayor entropía más desordenado. Todo fenómenos tiene un orden, por lo mismo puede llegar a estar completamente desordenado. Desde que se estableció el concepto de entropía apareció el tiempo, puesto que el universo dicen por ahí, tiene un fin; el desorden total.

Reglas de como funcionan las cosas (desde el punto de vista termodinámico):

1.- Cualquier cosa tiende a pasar de un estado de mayor energía a uno menor. (se desordena)
2.- Un sistema tiene menor energía que otro si tiene más partículas. (por eso las cosas tienden a romperse)
3.- Un sistema tiene menor energía que otro si las partículas están lo mas alejadas posibles de otras. (por eso las cosas tienden a mezclarse, el humo a dispersarse)

Pondré como ejemplo un pucho. El pucho está formado básicamente de celulosa (sabrosa, tóxica y enviciante celulosa). La celulosa es una cadena de miles de moléculas de glucosa juntas. Entonces es un sistema que esta MUY ordenado. Le prendemos fuego y lentamente comienza salir humo.
Lo que pasa es que pasamos de un sistema ordenado a una mucho más desordenado. Porque de una sola molécula de celulosa pasamos a miles de glucosa, y de miles de glucosa pasamos a más miles de dióxido de carbono. (preguntele a don Miguel si no me creen). Entonces cuando fumamos le hacemos un bien al universo al aumentarle la entropía.

Entonces las cosas que tienen mucha energía intrínseca, pueden producir mucha entropía. Generalmente los fenómenos con mucha energía, están muy ordenados. Y tienden al desorden a noser que le metamos energía.

Y fijénse en todas las cosas vivas, contienen en si una simetría. Los seres vivos son simétrico. La simetría es un reflejo del orden. Y para mantener ese orden se necesita aplicar energía. Por eso comemos.

La simetría no es sólo macroscopica, sino que nivel molecular tambien existe. Fijénse en la proteína de arriba. La simetría es la muestra más fiel del orden en un sistema, por lo mismo del estado energético que tiene.

Vida parte II: Lo superfluo de la Energía

2007-06-11T20:44:00.000-07:00

Energía. Es una palabra que hace años me ha perturbado. Todas las respuestas que alguna vez me dieron los profesores en el colegio me dejaban aún más enrabiado. Quizás fue por culpa de esta palabra que me hecharon de colegio. No comprenderla me volvía loco, me producía una angustía feroz. A lo largo de bioquímica, seguían hablando sobre este concepto tan loco, y de poco a poco comenzé a intuir su significado. Y creo que el catalizador fue conocer la estructura de la glucosa.

La glucosa es un carbohidrato (carbono hidratado, carbón (verde en foto) y agua(rojo y blanco)), es la fuente de energía más común de los seres vivientes. Curiosamente es el carbohidrato más común, del que más hay. ¿Curioso?. ¿Es sólo una concidencia que sea la fuente de energía más utilizada por los seres vivos y que además sea la que en más cantidad hay en el planeta?.

NO. La vida tiene la capacidad de adaptarse de la mejor manera a su ambiente. Entonces los seres que se alimentan de la glucosa tendrán más oportunidad que otros para alimentarse y por ende de sobrevivir y perdurar en la historia y el tiempo.
La glucosa es el carbohidrato más común porque es el más estable, tiene una estructura light, sus átomos no se joden tanto como los otros carbohidratos. Piénselo así, en una pieza chica, tienen 6 políticos, todos ellos abogados. Como todos saben los políticos y abogados son insoportables, nadie los soporta, ni ellos mismos. Si tenemos a los 6 en la misma pieza se distribuirán dentro de esta lo más alejados los unos de los otros para no joderse entre si y esa distribución formará un hexágono. Hagan la prueba con un papelito. Esto implica que la manera más estable osea con menor energía es esa. Si juntamos a los 6 en un rincón, se pondrán a pelear por tonteras como siempre. Por ende es una conformación la cuál no perdurará mucho en tiempo, por ende menos estable por ende con mayor energía. Los carbonos se comportan como los abogados, por eso toman esta conformación.

Ahora tomemos la misma analogía con parejas. Tenemos a los hombres (serán los carbonos), y las minas (que serán los oxígenos con hidrógenos (-OH)). Están en una pieza y se toman sus copetes y que pasará?. Suponiendo que cada mina elige un hombre, las parejas intentarán estar solitos sin joderse, como no hay mucho espacio se distribuyen de la manera en que menos se jodan entre si, osea cada pareja lo más alejada de todas las otra. Que tenemos? un hexágono. Esta estructura se mantendrá así hasta que llegué algo que la destruya. Por ejemplo imaginemos que llega el cura Hasbún a la pieza. Queda la cagá y las parejas arrancan para estar solitas a otra parte. Eso se llama combustión.

Si entendieron el porque los abogados y las parejas adoptan esa distribución, entenderán entonces que las formas y en el fondo las cosas existen en proporción a su nivel de energía. Cualquier cosa que tenga mayor frecuencia (osea, más veces) implica que es más estable.

Por lo mismo para saber que algo es más frecuente, implica tener un punto de referencia. Osea algo es más frecuente sólo porque otra cosa es menos frecuente. Entonces la energía es una descripción de un estado en particular en el tiempo y el espacio. Puesto que podemos comparar el mismo objeto en distintos lugares (como el ejemplo de la manzana pasado), o el mismo objeto en el mismo lugar en tiempos distintos (y si el objeto es igual pero el contexto es distinto su estado tb cambiará).

Entonces cuando les hablan de energía calórica, o energía química, o energía lo que sea, en el fondo es la descripción de un estado en algún contexto con respecto a otra cosa. Y todas las unidades (por ejemplo, las kilocalorías) el uno de esa unidad ( 1 kcal) es un objeto en especial bajo ciertas circunstancias ( 1 kilocaloría se definió (ojo, se definió) como el calor necesario para incrementar en 1 grado celsius la temperatura de un kilo de agua a presión atmosférica de uno) osea si "algo" tiene 2 kilocalorías quiere decir que se necesita el doble de calor que un kilo de agua para incrementar en un grado celsius un kilo de "algo". Pero también quiere decir que es más probable encontrar un kilo de agua con más temperatura que un kilo de algo.

Entonces la energía es una definición de CÚAL ES LA PROBABILIDAD DE QUE UN FENÓMENO OCURRA.

Esto no implica que los fenómenos con poca probabilidad de ocurrencia no existan, sino que implica que existirán menos veces dentro de algún contexto. Y esta probabilidad dependerá de sus propiedades y sus propiedades dependerán de la interacción de sus componentes. Entonces cuando hablamos de estabilidad, (osea que tanto perdura en el tiempo) también hablamos de cuanta energía posee y por ende de cuales son las propiedades de sus componentes y por ende hablamos también de cuál es la interacción entre sus componentes. (como los matrimonios, mientras menos ataos tienen más duran).

Por esto que cuesta caleta hacer una bomba atómica. Porque hacer que algo que sea poco frecuente ocurra implica mucho esfuerzo. Y cuando los fenómenos poco frecuentes ocurren tienden a provocar que ocurran otros fenómenos poco frecuentes (osea igual es raro que algún soldado gringo muera por radiación sin estar viendo una explosión atómica). Osea "la "energía" se transforma no se pierde".

Media volá. Salió enredada la wea.

¿Alguna pregunta?

Vida parte I: Vida y su energía.

2007-06-07T08:19:00.000-07:00

¿Que es una célula? Algo deben saber por ahí. La primera definición que es necesaria saber es que una célula es una unidad capaz de vivir independientemente. Osea, debe tener todo lo necesario para vivir. También debe ser capaz de reproducirse, osea a partir de una célula podríamos en teoría obtener otra igual o parecida.

Una característica esencial de los entes vivientes es que son capaces de diferenciarse del medio ambiente. Es muy choro ese concepto, puesto que cualquier cosa viva debe mantenerse distinta al medio. Tiene cantidades de moléculas, o átomos distinta al medio. Por ejemplo, un perro tiene mas concentración de sales dentro de su cuerpo que el aire (suena obvio no), los peces tienen distintas cantidades de sales que el mar (no tan obvio no?), o la levadura tiene distinta concentraciones de sales que la cerveza (para aquéllos que les gusta la cerveza no filtrada, esa media turbia. lo turbio de la cerveza es por la levadura).

Sólo esta característica implica que, TIENE UN ESTADO ENERGÉTICO DISTINTO. con un ejemplo simple, mezclen pisco con cocacola, estas dos se van a mezclar solas. porque? Porque la piscola tiene un estado de energía menor que las dos separadas. osea si quieren tener pisco y cocacola separados deben aplicar energía.

Para entender esto les daré un DOGMA. Todo tiende (osea va a pasar) de un estado energético mayor a uno menor. Las cosas inestables son inestables porque tienen mayor energía. Por ejemplo, si sostienen una manzana a un metro del suelo, y la sueltan, la manzana se cae no?. Esto es porque el estado energético de la manzana es menor en el suelo que a un metro, y la única forma de que esté a un metro del suelo es aplicando energía. Esa energía la aplicamos nosotros sosteniendo a la manzana. Y sino me creen traten de sostener una manzana a un metro del suelo por más de una hora. se van a cansar no?.

Entonces una células para mantener concentraciones distintas de sales que su medio, tiene que aplicar energía y para eso necesita producir energía, por eso comemos. Para poder estar vivos, y para estar vivos necesitamos diferenciarnos del medio.

Para confirmarlo imaginen que pasa con las cosas que mueren, de apoco se igualan al medio.

Entonces, suponiendo que quedó claro. Los seres vivos tienen un estado MAYOR de energía que su medio.

Si fuésemos una piscola, tendríamos separado el pisco de la cocacola.

¿Porque existe entonces? Si por dogma, las cosas tienden a llegar a un estado energético menor, a un equilibrio.

¿Cómo se justifica la vida?

Ver para creer

2007-06-01T16:05:00.001-07:00

Somos una raza desconfiada, al igual que todas en realidad, cada especie tiene un sentido rey. Y considero que nuestro sentido rey es la vista.

Creemos en lo que vemos, aunque sean alucinaciones irracionales (como por ejemplo, abogados con alma).

Al parecer tb tenemos la capacidad de ver lo que creemos, y se nota harto en especial con las mujeres que nos dicen "estoy gorda" (wuachita,.... no está gorda!!!) , o con esos tipos religiosos fanáticos que ven en una mancha de mayonesa añeja la cara de jesús, pero justo cuando estaba entre la 5ta y 6ta de la pasión.

Los científicos nesesitan ver, es la prueba de fuego: si se ve y se demuestra que lo que se ve es lo que uno dice ver, es. simple.

Pero ver cosas pequeñas casi abstractas, es un cacho, y grande. Entonces se las han ingeniado para poder ver cosas que a simple vista no se pueden ver.

Uno de estos métodos se llama inmunofluorescencia. Consiste en utilizar anticuerpos acoplados a proteínas que brillan (si en verdad me gustan estas weas). Los anticuerpos son proteínas y la gracia que tienen es que son capaces de reconocer cosas de manera extremadamente precisa (la Foto es una anticuerpo). Y son tan precisos que poniendo como ejemplo Santiago, son capaces de reconocer sólo aquéllas personas con un dedo chico del pie derecho con uña larga y pintadas (demás que hay algún freaky que las ocupa así), y eso. no reconoce un dedo chico del pie izquierdo con uña larga y pintada, ni un dedo chico de pie izquierdo con uña larga pero no pintada, ni... supongo que se entiende. Para tener un concepto de la escala, miden aprox. 7.1 nanometros, osea 0.0000000071 metros, hay que pensar que el ancho de un pelo es de 25 micrometros, osea 0.000025 metros, osea un anticuerpo es 3500 veces más chico. Los anticuerpos las ocupan células de defensa especializadas.

Los anticuerpos reconocen cosas que no pertenecen al cuerpo (OJO con el concepto molecular de identidad ahí, es re interesante, puesto que no reconoce cuando algo es peligroso o patógeno, sino que reconoce cualquier cosa que NO sea nuestra, osea estas células se entrenan para reconocer las cosas que nos pertenecen, (digo cosas pero en realidad se les llama epítope, que puede ser cualquier parte de una proteína, lípido, carbohidrato, etc.), cuando reconocen cualquier cosa que NO nos pertenece la destruyen. Las enfermedades autoinmunes son aquellas en las cuales el sentido de individuo a nivel molecular caga, entonces las propias células que nos protegen nos detruyen, por eso son las enfermedades más brígidas.)

Entonces ahora, somos capaces de tener anticuerpos que reconozcan específicamente lo que queramos. Entonces para hacerlos tomamos un conejo que tendrá anticuerpos de conejo, y le inyectamos el pedazo que queremos que reconozca, entonces las células de defensa lo reconoceran y se multiplicarán y tiran a la sangre anticuerpos para alertar que existe algo extraño y con el anticuerpo son capaces comunican QUE es lo extraño y todas empiezan a tirar ese anticuerpo. cool no? eso pasa a cada rato dentro de nosotros. entonces le sacamos sangre al conejito y sacamos el anticuerpo que queremos.

Okay, podemos reconocer cualquier cosa. Ahora para verlas tiramos el anticuerpo de conejo que reconoce lo que queremos y después le ponemos otro anticuerpo que tiene unido una proteína que brilla que reconoce anticuerpos de conejo, entonces se juntan como pololos y vemos con el color que queramos, lo que queramos en un microscopio normal.

Se entendió?

Ojalá, ahora viene la galería. La primera foto (la de arriba), es una foto que saqué en un microscopio, la luz verde es el virus HANTA y el rojo son las células infectadas.
Bonito o no? Se parece a esas fotos de galaxias y cosas asi. Me encanta esta wea, es lo máximo.

Entonces podemos ponerle color a cualquier cosa. Les pondré fotos que encontre en internet. En ésta hay tres colores para cada cosa, la verde es el equeleto de una célula que se llama citoesqueleto (compuesto de una proteína que se llama actina), lo amarillo es el retículo endoplasmático, es un compartimiento de la células que sirve pa enchular las proteínas o darles formas, y lo azul es el núcleo de la célula (donde esta el DNA).

Aquí los anticuerpos reconocen proteínas que se unen a DNA, osea, están viendo DNA.
coolisimo!!!

Esta es una Tetrahymena pegandose un polvito (sex compadre!), éstos son organismos unicelulares (son una célula nu más)(nosotros somos pluriceluleres, más o menos tenemos 100 trillones de células). Ven las patitas que tiene? las ocupan para movilizarse, heavy igual que célula sepa pa donde moverse, de otro día hablaré de sensores y motores moleculares. Quimiotaxis compadre!!!!

Otra de esta cosa.

Virus-Cell Interaction
Joerg Schroeer
Department of Molecular Biology
Human cytomegalovirus infected human endothelial cells. Multicolor Immunofluorescence

LARII, bioluminiscencia en un tubo.

2007-05-30T18:02:00.000-07:00

Me gustan las cosas que brillan.

Más aun si esa cosa es una proteína. Por eso cualquier ser que sea capaz de emitir luz merece mi admiración.

Mi sueño es tener una de esas jibias que cambian de color según la situación a la cual se enfrentan. Seres morfológicamente horrendos pero que emiten luces con patrones bellísimos y de mil colores distintos.

Se le denomina bioluminiscencia, porque son seres vivos los que son capaces de emitir luz. y la luz es producto de una reacción química entre una proteína y un sustrato. La longitud de onda dependera de la proteína y del sustrato que ocupe.

esta es al reacción que cataliza la luciferasa.

¿Porqué un insecto necesita emitir luz?

Al parecer es por la misma razón por la cual nosotros hablamos. Ellas se comunican atravez de patrones de emisión. ojo, se C O M U N I C A N. Esto implica poder comprender un código.

otro ojo. son I N S E C T O S. Jajaja que loco. otro día escribiré sobre la comunicación en abejas.

Okay. Las luciérnagas emiten luz. Gracias a la luciferasa y su sustrato luciferin. (la proteína de la foto es la luciferasa).

¿Quien hizo a quien? ¿La luciferasa a la luciérnaga o la luciérnaga a la luciferasa?

Como evoluciona una proteína que emite luz???!!!!
Porque se seleccionaron los insectos capaces de emitir luz?
Quizás alguna vez nació un humano capaz de emitir luz. Pero no era apto a su contexto asique murió rápido. Además no creo que una humana primitiva encuentre atractivo un humano emitidor de luz. Seguro que era el idiota de la cueva. y lo tenían parado en la mitad de ella. Día y noche. es peluo pasar piola con su chiquilla si emitieras luz constantemente. Por algo vamos a miradores o apagamos la luz. Tiene sus ventajas según la compañia, pero desde un punto de vista ñoño (osea el mio) sería para que los depredares no nos cachen en el momento de mayor debilidad de un humano.

Tengo la suerte de tener esa proteína en un tubo. y ademas tengo la suerte de ser el encargado del sustrato (luciferin) en el laboratorio. Debo alicuotar 10000 microlitros en 150 microlitros. Son más o menos 75 tubos con LARII (luciferasa assay reaction dos).

y a esos tubos, les saco fotos.