sábado, junio 30, 2007

Vida parte IV: Arte y energía.



Hace poco di una clase en un colegio sobre las cosas que escribo acá. Y a las cabras les costó cachar bien los conceptos, puede ser que haya sido por el poco tiempo que tuve para dar mi clase, y al parecer también es re jodido el tema. De todas maneras seguiré escribiendo sobre estas cosas para pasar a otros temas ñoños. Creo que este post será el último con respecto a energía, pero será el más interesante. El tema no lo manejo bien (los anteriores tampoco) pero si creo tener nociones sobre el tema, esto lo aprendí con mi gran amigo Evandro, que ahora esta en Suiza, mientras nos tomábamos el casi sagrado café del día pelando el cable sobre ciencias y sobre la vida (que ha estado ultra movida estas últimas 4 semanas)

Espero que hayan quedado claros ciertos conceptos de los otros posts.

Este post relacionará el concepto de energía con la información. La definición que sale en google es:"Information is the result of processing, manipulating and organizing data in a way that adds to the knowledge of the person receiving it". Esto incluye todo tipo de lenguaje, todo lo referente a las percepciones (visual, sonidos, tacto, etc). Se entiende, cierto?

Imaginen que tienen una bolsa llena de las letras para las sopas. Toman todas las letras y las tiran. Cuál es la probabilidad de que cada vez que tiramos las letras al suelo se formen palabras con sentido y que éstas formen frases coherentes?.

Ninguna!!!!!! Sería súper difícil. La probabilidad es muy pequeña.

Como sabemos de los post anteriores, cualquier fenómeno que tenga una probabilidad muy pequeña de que suceda, y sucede, requirió mucha energía para poder existir. Por consecuencia si existe, contiene en sí mucha energía.

Eso ocurre con la información.

Podemos darles un valor energético a la información, y por lo mismo podemos darle un valor de probabilidad a la información contenida en cualquier cosa.

Bueno, para que algo contenga información necesariamente tiene que ser comprendido, y también podemos darle un valor de probabilidad a que la información sea comprendida.

Por ejemplo, cuál es la probabilidad de que ustedes entiendan lo mismo que yo cuando les pongo la palabra "instrumento". No es muy alta, puesto que unos se imaginarán instrumentos musicales, otros herramientas. Ahora, si lo pongo en una frase "toqué música con mi instrumento", el hecho de ponerle un contexto aumenta la probabilidad de que lo entiendan, y cada palabra tiene una probabilidad, y juntas en un orden aumentan la probabilidad de que entiendan exactamente lo que les quiero decir.


El arte contiene energía porque es información, la música también, los poemas.

Y cada uno tiene niveles de energía distintos, por ejemplo es mucho mas fácil explicar algo con un libro, pero con un poema es más complejo, y por eso la densidad de energía es mayor en un poema, puesto que la misma información que está contenida en el libro que tiene por ejemplo 300000 palabras, está contenida en un poema que tiene 100.

Toda obra de arte contiene energía. Y la música!!!! jajajaja es muy entretenido este tema. Y cada obra para ser creada requiere de mucha energía. Recuerdan el ejemplo de la bomba atómica en un post "lo superfluo de la energía"?. cito: "Porque hacer que algo que sea poco frecuente ocurra implica mucho esfuerzo. Y cuando los fenómenos poco frecuentes ocurren tienden a provocar que ocurran otros fenómenos poco frecuentes". Les suena eso como a arte?. Los artistas crean el mundo que viene.

Por eso admiro a los artistas, ya sean músicos, pintores, poetas, etc, etc.

Y aunque todos mis amigos crean que soy más artista que científico, y de que siempre debí haber estudiado eso, lamentablemente no lo soy. Aunque haya vivido como un poeta beatnick buena onda y loco (como me dijeron ayer que era).

Espero ser artista después de terminar bioquímica mientras haga mi doctorado en alguna parte lejana de este mundo.

Y quiero porque no sólo es una frustración, sino porque son los artistas los que más saben sobre lo único importante, lo que rige al mundo y sus personas.

La esencia de la vida.




Vida parte I: Vida y su energía.

Vida parte II: Lo superfluo de la Energía

Vida parte III: La entropía del pucho.

Vida parte IV: Arte y energía.

miércoles, junio 27, 2007

Tributo



Este post, será un tributo a esos amigos científicos.

Lo más importante de mi paso por la universidad fue conocerlos.

Aquellos que me conocen sabrán que vivo en un mundo muy abstracto. Vagando romántico medio loco por la vida. Todas mis locuras y extraña forma de ser fueron apreciadas. Con estas personas logré encontrar un nicho en el cúal todas mis preguntas, frustraciones, dudas, y alegrías fueron comprendidas y acogidas.

Ellos siempre tuvieron más confianza en mi de lo que yo la tenía. Y sus consejos y apoyo fueron importantísimos.

He comprendido mis debilidades y fortalezas, Y creo que estoy comenzando a amarlas. Como consecuencia, recien ahora siento que soy capaz de lograr amar lo que hago, y amarme haciendolo.

Y estos compadres, fueron escenciales en este proceso. En este minuto están todos fuera de Chile, viviendo duramente, como hijos del rigor por una pasión más grande que por lo inmediato.


He aprendido más de ellos que de cualquier libro o paper.

Y con este humilde post, les declaro mi admiración y cariño.

Gracias!.

jueves, junio 21, 2007

Vida parte III: La entropía del pucho.


Entropía es una palabra que suena cool. Pero no es fácil de entender, (yo no la entiendo bien) pero humildemente intentaré explicarla.

Imaginemos el sistema más estable que puede existir. Este sería un sistema en el cuál todas las partículas están lo más alejadas una de la otra. Tendrá que ser un sistema completamente desordenado. Este sistema se definirá como el estado con máxima entropía.
Ahora, cualquier proceso que ayude a que el estado universal se acerque a ese sistema ficticio producirá entropía. Entonces si todos los fenómenos pasaran de un estado de menor entropía a uno de máxima entropía llegaríamos al estado ficticio de máxima entropía donde nada se diferenciaría de nada y todo estaría alejado de todo. Como todos sabemos nosotros no vivimos en un universo así, ni en un planeta así. La entropía entonces define el desorden de un sistema. A mayor entropía más desordenado. Todo fenómenos tiene un orden, por lo mismo puede llegar a estar completamente desordenado. Desde que se estableció el concepto de entropía apareció el tiempo, puesto que el universo dicen por ahí, tiene un fin; el desorden total.

Reglas de como funcionan las cosas (desde el punto de vista termodinámico):

1.- Cualquier cosa tiende a pasar de un estado de mayor energía a uno menor. (se desordena)
2.- Un sistema tiene menor energía que otro si tiene más partículas. (por eso las cosas tienden a romperse)
3.- Un sistema tiene menor energía que otro si las partículas están lo mas alejadas posibles de otras. (por eso las cosas tienden a mezclarse, el humo a dispersarse)

Pondré como ejemplo un pucho. El pucho está formado básicamente de celulosa (sabrosa, tóxica y enviciante celulosa). La celulosa es una cadena de miles de moléculas de glucosa juntas. Entonces es un sistema que esta MUY ordenado. Le prendemos fuego y lentamente comienza salir humo.
Lo que pasa es que pasamos de un sistema ordenado a una mucho más desordenado. Porque de una sola molécula de celulosa pasamos a miles de glucosa, y de miles de glucosa pasamos a más miles de dióxido de carbono. (preguntele a don Miguel si no me creen). Entonces cuando fumamos le hacemos un bien al universo al aumentarle la entropía.

Entonces las cosas que tienen mucha energía intrínseca, pueden producir mucha entropía. Generalmente los fenómenos con mucha energía, están muy ordenados. Y tienden al desorden a noser que le metamos energía.

Y fijénse en todas las cosas vivas, contienen en si una simetría. Los seres vivos son simétrico. La simetría es un reflejo del orden. Y para mantener ese orden se necesita aplicar energía. Por eso comemos.

La simetría no es sólo macroscopica, sino que nivel molecular tambien existe. Fijénse en la proteína de arriba. La simetría es la muestra más fiel del orden en un sistema, por lo mismo del estado energético que tiene.











Vida parte I: Vida y su energía.

Vida parte II: Lo superfluo de la Energía

Vida parte III: La entropía del pucho.

Vida parte IV: Arte y energía.

lunes, junio 11, 2007

Vida parte II: Lo superfluo de la Energía


Energía. Es una palabra que hace años me ha perturbado. Todas las respuestas que alguna vez me dieron los profesores en el colegio me dejaban aún más enrabiado. Quizás fue por culpa de esta palabra que me hecharon de colegio. No comprenderla me volvía loco, me producía una angustía feroz. A lo largo de bioquímica, seguían hablando sobre este concepto tan loco, y de poco a poco comenzé a intuir su significado. Y creo que el catalizador fue conocer la estructura de la glucosa.


La glucosa es un carbohidrato (carbono hidratado, carbón (verde en foto) y agua(rojo y blanco)), es la fuente de energía más común de los seres vivientes. Curiosamente es el carbohidrato más común, del que más hay. ¿Curioso?. ¿Es sólo una concidencia que sea la fuente de energía más utilizada por los seres vivos y que además sea la que en más cantidad hay en el planeta?.

NO. La vida tiene la capacidad de adaptarse de la mejor manera a su ambiente. Entonces los seres que se alimentan de la glucosa tendrán más oportunidad que otros para alimentarse y por ende de sobrevivir y perdurar en la historia y el tiempo.
La glucosa es el carbohidrato más común porque es el más estable, tiene una estructura light, sus átomos no se joden tanto como los otros carbohidratos. Piénselo así, en una pieza chica, tienen 6 políticos, todos ellos abogados. Como todos saben los políticos y abogados son insoportables, nadie los soporta, ni ellos mismos. Si tenemos a los 6 en la misma pieza se distribuirán dentro de esta lo más alejados los unos de los otros para no joderse entre si y esa distribución formará un hexágono. Hagan la prueba con un papelito. Esto implica que la manera más estable osea con menor energía es esa. Si juntamos a los 6 en un rincón, se pondrán a pelear por tonteras como siempre. Por ende es una conformación la cuál no perdurará mucho en tiempo, por ende menos estable por ende con mayor energía. Los carbonos se comportan como los abogados, por eso toman esta conformación.

Ahora tomemos la misma analogía con parejas. Tenemos a los hombres (serán los carbonos), y las minas (que serán los oxígenos con hidrógenos (-OH)). Están en una pieza y se toman sus copetes y que pasará?. Suponiendo que cada mina elige un hombre, las parejas intentarán estar solitos sin joderse, como no hay mucho espacio se distribuyen de la manera en que menos se jodan entre si, osea cada pareja lo más alejada de todas las otra. Que tenemos? un hexágono. Esta estructura se mantendrá así hasta que llegué algo que la destruya. Por ejemplo imaginemos que llega el cura Hasbún a la pieza. Queda la cagá y las parejas arrancan para estar solitas a otra parte. Eso se llama combustión.

Si entendieron el porque los abogados y las parejas adoptan esa distribución, entenderán entonces que las formas y en el fondo las cosas existen en proporción a su nivel de energía. Cualquier cosa que tenga mayor frecuencia (osea, más veces) implica que es más estable.

Por lo mismo para saber que algo es más frecuente, implica tener un punto de referencia. Osea algo es más frecuente sólo porque otra cosa es menos frecuente. Entonces la energía es una descripción de un estado en particular en el tiempo y el espacio. Puesto que podemos comparar el mismo objeto en distintos lugares (como el ejemplo de la manzana pasado), o el mismo objeto en el mismo lugar en tiempos distintos (y si el objeto es igual pero el contexto es distinto su estado tb cambiará).


Entonces cuando les hablan de energía calórica, o energía química, o energía lo que sea, en el fondo es la descripción de un estado en algún contexto con respecto a otra cosa. Y todas las unidades (por ejemplo, las kilocalorías) el uno de esa unidad ( 1 kcal) es un objeto en especial bajo ciertas circunstancias ( 1 kilocaloría se definió (ojo, se definió) como el calor necesario para incrementar en 1 grado celsius la temperatura de un kilo de agua a presión atmosférica de uno) osea si "algo" tiene 2 kilocalorías quiere decir que se necesita el doble de calor que un kilo de agua para incrementar en un grado celsius un kilo de "algo". Pero también quiere decir que es más probable encontrar un kilo de agua con más temperatura que un kilo de algo.

Entonces la energía es una definición de CÚAL ES LA PROBABILIDAD DE QUE UN FENÓMENO OCURRA.

Esto no implica que los fenómenos con poca probabilidad de ocurrencia no existan, sino que implica que existirán menos veces dentro de algún contexto. Y esta probabilidad dependerá de sus propiedades y sus propiedades dependerán de la interacción de sus componentes. Entonces cuando hablamos de estabilidad, (osea que tanto perdura en el tiempo) también hablamos de cuanta energía posee y por ende de cuales son las propiedades de sus componentes y por ende hablamos también de cuál es la interacción entre sus componentes. (como los matrimonios, mientras menos ataos tienen más duran).

Por esto que cuesta caleta hacer una bomba atómica. Porque hacer que algo que sea poco frecuente ocurra implica mucho esfuerzo. Y cuando los fenómenos poco frecuentes ocurren tienden a provocar que ocurran otros fenómenos poco frecuentes (osea igual es raro que algún soldado gringo muera por radiación sin estar viendo una explosión atómica). Osea "la "energía" se transforma no se pierde".




Media volá. Salió enredada la wea.

¿Alguna pregunta?





Vida parte I: Vida y su energía.

Vida parte II: Lo superfluo de la Energía

Vida parte III: La entropía del pucho.

Vida parte IV: Arte y energía.

jueves, junio 07, 2007

Vida parte I: Vida y su energía.



¿Que es una célula? Algo deben saber por ahí. La primera definición que es necesaria saber es que una célula es una unidad capaz de vivir independientemente. Osea, debe tener todo lo necesario para vivir. También debe ser capaz de reproducirse, osea a partir de una célula podríamos en teoría obtener otra igual o parecida.


Una característica esencial de los entes vivientes es que son capaces de diferenciarse del medio ambiente. Es muy choro ese concepto, puesto que cualquier cosa viva debe mantenerse distinta al medio. Tiene cantidades de moléculas, o átomos distinta al medio. Por ejemplo, un perro tiene mas concentración de sales dentro de su cuerpo que el aire (suena obvio no), los peces tienen distintas cantidades de sales que el mar (no tan obvio no?), o la levadura tiene distinta concentraciones de sales que la cerveza (para aquéllos que les gusta la cerveza no filtrada, esa media turbia. lo turbio de la cerveza es por la levadura).

Sólo esta característica implica que, TIENE UN ESTADO ENERGÉTICO DISTINTO. con un ejemplo simple, mezclen pisco con cocacola, estas dos se van a mezclar solas. porque? Porque la piscola tiene un estado de energía menor que las dos separadas. osea si quieren tener pisco y cocacola separados deben aplicar energía.

Para entender esto les daré un DOGMA. Todo tiende (osea va a pasar) de un estado energético mayor a uno menor. Las cosas inestables son inestables porque tienen mayor energía. Por ejemplo, si sostienen una manzana a un metro del suelo, y la sueltan, la manzana se cae no?. Esto es porque el estado energético de la manzana es menor en el suelo que a un metro, y la única forma de que esté a un metro del suelo es aplicando energía. Esa energía la aplicamos nosotros sosteniendo a la manzana. Y sino me creen traten de sostener una manzana a un metro del suelo por más de una hora. se van a cansar no?.

Entonces una células para mantener concentraciones distintas de sales que su medio, tiene que aplicar energía y para eso necesita producir energía, por eso comemos. Para poder estar vivos, y para estar vivos necesitamos diferenciarnos del medio.

Para confirmarlo imaginen que pasa con las cosas que mueren, de apoco se igualan al medio.

Entonces, suponiendo que quedó claro. Los seres vivos tienen un estado MAYOR de energía que su medio.

Si fuésemos una piscola, tendríamos separado el pisco de la cocacola.

¿Porque existe entonces? Si por dogma, las cosas tienden a llegar a un estado energético menor, a un equilibrio.

¿Cómo se justifica la vida?










viernes, junio 01, 2007

Ver para creer



Somos una raza desconfiada, al igual que todas en realidad, cada especie tiene un sentido rey. Y considero que nuestro sentido rey es la vista.

Creemos en lo que vemos, aunque sean alucinaciones irracionales (como por ejemplo, abogados con alma).

Al parecer tb tenemos la capacidad de ver lo que creemos, y se nota harto en especial con las mujeres que nos dicen "estoy gorda" (wuachita,.... no está gorda!!!) , o con esos tipos religiosos fanáticos que ven en una mancha de mayonesa añeja la cara de jesús, pero justo cuando estaba entre la 5ta y 6ta de la pasión.

Los científicos nesesitan ver, es la prueba de fuego: si se ve y se demuestra que lo que se ve es lo que uno dice ver, es. simple.

Pero ver cosas pequeñas casi abstractas, es un cacho, y grande. Entonces se las han ingeniado para poder ver cosas que a simple vista no se pueden ver.


Uno de estos métodos se llama inmunofluorescencia. Consiste en utilizar anticuerpos acoplados a proteínas que brillan (si en verdad me gustan estas weas). Los anticuerpos son proteínas y la gracia que tienen es que son capaces de reconocer cosas de manera extremadamente precisa (la Foto es una anticuerpo). Y son tan precisos que poniendo como ejemplo Santiago, son capaces de reconocer sólo aquéllas personas con un dedo chico del pie derecho con uña larga y pintadas (demás que hay algún freaky que las ocupa así), y eso. no reconoce un dedo chico del pie izquierdo con uña larga y pintada, ni un dedo chico de pie izquierdo con uña larga pero no pintada, ni... supongo que se entiende. Para tener un concepto de la escala, miden aprox. 7.1 nanometros, osea 0.0000000071 metros, hay que pensar que el ancho de un pelo es de 25 micrometros, osea 0.000025 metros, osea un anticuerpo es 3500 veces más chico. Los anticuerpos las ocupan células de defensa especializadas.

Los anticuerpos reconocen cosas que no pertenecen al cuerpo (OJO con el concepto molecular de identidad ahí, es re interesante, puesto que no reconoce cuando algo es peligroso o patógeno, sino que reconoce cualquier cosa que NO sea nuestra, osea estas células se entrenan para reconocer las cosas que nos pertenecen, (digo cosas pero en realidad se les llama epítope, que puede ser cualquier parte de una proteína, lípido, carbohidrato, etc.), cuando reconocen cualquier cosa que NO nos pertenece la destruyen. Las enfermedades autoinmunes son aquellas en las cuales el sentido de individuo a nivel molecular caga, entonces las propias células que nos protegen nos detruyen, por eso son las enfermedades más brígidas.)

Entonces ahora, somos capaces de tener anticuerpos que reconozcan específicamente lo que queramos. Entonces para hacerlos tomamos un conejo que tendrá anticuerpos de conejo, y le inyectamos el pedazo que queremos que reconozca, entonces las células de defensa lo reconoceran y se multiplicarán y tiran a la sangre anticuerpos para alertar que existe algo extraño y con el anticuerpo son capaces comunican QUE es lo extraño y todas empiezan a tirar ese anticuerpo. cool no? eso pasa a cada rato dentro de nosotros. entonces le sacamos sangre al conejito y sacamos el anticuerpo que queremos.

Okay, podemos reconocer cualquier cosa. Ahora para verlas tiramos el anticuerpo de conejo que reconoce lo que queremos y después le ponemos otro anticuerpo que tiene unido una proteína que brilla que reconoce anticuerpos de conejo, entonces se juntan como pololos y vemos con el color que queramos, lo que queramos en un microscopio normal.

Se entendió?

Ojalá, ahora viene la galería. La primera foto (la de arriba), es una foto que saqué en un microscopio, la luz verde es el virus HANTA y el rojo son las células infectadas.
Bonito o no? Se parece a esas fotos de galaxias y cosas asi. Me encanta esta wea, es lo máximo.

Entonces podemos ponerle color a cualquier cosa. Les pondré fotos que encontre en internet. En ésta hay tres colores para cada cosa, la verde es el equeleto de una célula que se llama citoesqueleto (compuesto de una proteína que se llama actina), lo amarillo es el retículo endoplasmático, es un compartimiento de la células que sirve pa enchular las proteínas o darles formas, y lo azul es el núcleo de la célula (donde esta el DNA).




Aquí los anticuerpos reconocen proteínas que se unen a DNA, osea, están viendo DNA.
coolisimo!!!





Esta es una Tetrahymena pegandose un polvito (sex compadre!), éstos son organismos unicelulares (son una célula nu más)(nosotros somos pluriceluleres, más o menos tenemos 100 trillones de células). Ven las patitas que tiene? las ocupan para movilizarse, heavy igual que célula sepa pa donde moverse, de otro día hablaré de sensores y motores moleculares. Quimiotaxis compadre!!!!







Otra de esta cosa.














Virus-Cell Interaction
Joerg Schroeer
Department of Molecular Biology
Human cytomegalovirus infected human endothelial cells. Multicolor Immunofluorescence